La Biblioteca Central de la Universidad nació con la institución que le dio origen, el Instituto Universitario de Tandil, en 1964. Se inició con la donación de los libros del fundador del Instituto: Dr. Osvaldo Zarini. Cuando años más tarde el Instituto fue reconocido como Universidad de Tandil la colección se acrecentó con otras importantes donaciones de profesionales de la ciudad y profesores de la Casa (en ese entonces casi todos viajaban a dar clases desde Buenos Aires o La Plata)
En el año 1975 la Universidad de Tandil, el Instituto Universitario de Olavarría y el Departamento de Ciencias Agrarias de Azul pasaron a integrar la Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires (Ley 20753 del 9 de octubre de 1974)
La tarea de organizar la nueva Universidad fue delegada en el Dr. Raúl C. Cruz quien fue su primer Rector, que junto con la organización de todos los departamentos funcionales creó el Departamento de Biblioteca dependiente de la Secretaría Académica, designó un director y una planta funcional. A partir de ese momento se organizó la Biblioteca Central con sede en Tandil y las Bibliotecas de las Facultades de Ingeniería, con sede en Olavarría, y de Agronomía con sede en Azul.
Para los aspectos técnicos se contó con la colaboración del Director de la Biblioteca Central de la Universidad Nacional del Sur, Lic. Atilio Peralta, que con un equipo de trabajo viajó a Tandil y asesoró en todos los aspectos organizativos y se convirtió además en fuente de consulta permanente ante cualquier duda
En 1982 se desarrolló un programa de computación para incorporar los datos de las obras existentes en Biblioteca central que permitió obtener listados por temas y por autor, siendo una de las primeras bibliotecas universitarias que contaron con este avance. La colección se incrementó en forma notable al contar cada Facultad con presupuesto anual para la adquisición de bibliografía y también con importantes donaciones hasta llegar a tener en la actualidad 47700 títulos, 65.500 volúmenes y más de 340 títulos de publicaciones periódicas en Biblioteca Central
En 1990 se crearon las Bibliotecas especializadas en Departamentos e Institutos.
En 1992 se comenzó a utilizar el Sistema Micro Isis para gestión de bases de datos bibliográficos. A la fecha, cada biblioteca del Sistema, tiene una base de libros y una de publicaciones periódicas, y se cuenta con un catálogo en línea en el que se pueden hacer consultas simultáneas en todas las bases del Sistema. El registro de lectores y el control de los préstamos también está computarizado.
A partir de 1997 se incorporaron bases de datos en CD Rom y conexión a Internet.
A partir del año 2004 se comenzó la migración en Biblioteca Central a Catalis que es una aplicación web que permite administrar bases de datos CDS/ISIS con registros bibliográficos en formato MARC 21.
En el año 2006 por Resolución Nº3093 fue creado Sistema de Bibliotecas de la UNICEN, que está compuesto por Biblioteca Central (Campus Universitario Tandil), las bibliotecas de la Sede Olavarría (Campus Universitario Olavarría y Escuela Superior de Ciencias de la Salud), las bibliotecas de la Sede Azul (Campus Universitario Azul y Biblioteca de Centro de Investigación y Posgrado de la Facultad de Derecho), la biblioteca de la Unidad de Enseñanza Universitaria de Quequén y la biblioteca de la Escuela Nacional Ernesto Sábato. Además, de las bibliotecas de los institutos, laboratorios, departamentos y de las distintas facultades que tienen bibliotecas especializadas. Cada una de ellas posee una Base de Datos online relevada por personal de procesos técnicos de la Biblioteca Central e integran el Catálogo Colectivo del Sistema.
Hoy las Bibliotecas cuentan desde 2015, además de su creciente cantidad de libros y publicaciones periódicas, el acceso a información virtual a través del Repositorio Institucional Digital de Acceso Abierto (RIDAA), conformado por los objetos digitales generados por la UNICEN. Actualmente se encuentran en texto completo disponibles alrededor de 3000 documentos digitales.
En el año 2017 se realizó una nueva migración en Biblioteca Central al Sistema Integrado de Gestión de Bibliotecas KOHA, en el marco del proyecto de migración de todas las bibliotecas pertenecientes al Sistema hacia este software, que brinda mayores posibilidades de obtener diferentes tipos de informes, reportes y estadísticas enriqueciendo la toma de decisiones a nivel gestión, operativamente unifica los criterios de catalogación y clasificación, además de simplificar el sistema de préstamos ya que los usuarios se cargan en una biblioteca pero pueden gozar de las prestaciones de las otras por ser reconocidos por el sistema.
A la fecha ya se han agregado al Sistema Koha las bibliotecas de Escuela Nacional Ernesto Sábato y Unidad de Enseñanza Universitaria de Quequén, estando en proceso la migración de las bibliotecas de Campus Universitario Olavarría, Campus Universitario Azul, Centro de Investigación y Posgrado de Derecho y Facultad de Ciencias de la Salud.